Cette comptabilité est tenue site par site. Sont ainsi distingués les comptes portant sur l'ensemble des établissements, puis ceux portant sur certains d'entre eux. Il est à noter que la comptabilité concernant le premier hôpital Saint-Eloi est conservée dans la sous-série 1 HDT (voir sources complémentaires).

1 HDT 1 M 4-17 : journal de recettes et dépenses pour l'hôpital Saint-Eloi (1790-1851).