La politique foncière, qui commence dès 1962, est antérieure à la création de la Mission interministérielle. L'Etat n'apparaît alors pas directement dans les acquisitions foncières préalables aux aménagements car cela aurait fait monter les prix. Les acquisitions se font donc par l'intermédiaire du fonds national d'aménagement foncier et urbain (FNAFU) qui justifie ces achats par des préoccupations d'assainissement ou de boisement.

Dès la création de la Mission, l'AALR délimite les périmètres par des enquêtes parcellaires. L'évaluation du prix des terrains appartenant aux propriétaires est établie par le service des Domaines (sous l'autorité du Ministère de la Construction). Les estimations sont ensuite transmises à la Mission interministérielle (M. BARISEEL).

Les terrains acquis par le FNAFU sont progressivement rétrocédés aux sociétés d'économie mixte (SEM) pour qu'elles procèdent aux aménagements et équipements dans le cadre d'un programme élaboré par l'Administration (Mission interministérielle).