La ville de Maguelonne, créée sur une île par les Grecs, a été sous occupation romaine et fait partie des 24 oppidums de Nîmes. Elle est le siège de l'évêché dès le VIème siècle jusqu'en 737, date à laquelle Charles Martel détruit la ville, après qu'elle ait été prise par les Sarrasins. Le siège épiscopal est alors transféré à Substantion (près de Castelnau-le-Lez) jusqu'en 1037 et les habitants s'instalent au bord des étangs. C'est ainsi que naît Villeneuve (Villa Nova). Aux XIème et XIIème siècles, Villeneuve-lès-Maguelone est le refuge de plusieurs papes chassés de Rome. Par la suite, le siège épiscopal est installé définitivement à Montpellier en 1536, ce qui entraîne la désertification du site et donc le déclin de Maguelonne. Disputée par les catholiques et les protestants, Maguelonne est démantelée sur ordre du roi Louis XIII en 1622.

Il y avait une cathédrale dédiée à Saint-Pierre, datant des XIIème et XIIIème siècles et deux autres églises, Saint-Blaise et Saint-Jean, et surtout la collégiale de la Sainte-Trinité transférée à Montpellier en 1570, après sa destruction, et dont le chapitre assurait la présentation à plusieurs paroisses.

Le 18 avril 1816, Villeneuve-lès-Maguelone prend le nom de Villeneuve-Angoulême.

Le 28 avril 1831, la commune reprend son ancien nom de Villeneuve-lès-Maguelone.

A la fin du XIXème siècle la ville prospère grâce à la vigne, dont les fruits peuvent être exportés grâce à la ligne de TGV Montpellier - Sète. Cependant, le philoxéra ruine les vignobles, ce qui entraîne son déclin. C'est cette même ressource, associée à l'exploitation des salins, qui permet à Villeneuve d'à nouveau prospérer pendant l'entre-deux guerres.

Les archives anciennes de Villeneuve-lès-Maguelone (antérieures à 1790) ainsi qu'une partie des archives modernes jusqu'au début du XXe siècle - dont l'état civil jusqu'en 1902 - ont déposées aux Archives départementales de l'Hérault. L'autre partie des archives modernes (1792-1982) et les archives contemporaines (postérieures à 1982) sont conservées dans la commune et ont fait l'objet d'un classement par la Mission archives du Centre de gestion de l'Hérault en 2020.

ALZIEU Gérard. Les églises de l'ancien diocèse de Maguelone-Montpellier. - Montpellier : P. Clerc, 2006.- 207 p. (Archives départementales de l'Hérault, coté BRA 5530 et BIB 1960)

ALBAGNAC L., PELLECUER C., MONTJARDIN R. La Station chalcolithique de l'Eau Perie, commune de Villeneuve-les-Maguelonne Hérault. In : Bulletin de la Société d'études scientifiques de Sète et de sa région 1974-VI - 1975-VII ; pp. 31-38 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 1316)

ALBAGNAC L. Un exemple d'occupation continue, la Madeleine (Villeneuve-les-Maguelonne). In : Bulletin de la Société d'études scientifiques de Sète et de sa région 1974-VI - 1975-VII ; pp. 27-30 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 1316)

AMBERT Martine. L'île de Maguelone : environnement et contraintes à l'époque médiévale. In : L'évêché de Maguelone au Moyen Age : actes de la journée d'études du 13 décembre 2001, 2005. pp. 11-26 (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole)

ARNAL Jean. Station néolithique de la Madeleine (Villeneuve-lès-Maguelonne, Hérault). In : Bulletin de la Société préhistorique française, septembre-octobre 1947 (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole)

Autour des recherches de Frédéric Fabrège, des découvertes archéologiques restées inédites à Maguelone, Villeneuve-les-Maguelone (Hérault). In : Archéologie du Midi médiéval 1996, tome 14, pp. 69-95 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 1351)

BARRUOL Guy, GARNOTEL Alexandrine. Une église funéraire paléochrétienne à Maguelone. In : L'évêché de Maguelone au Moyen Age : actes de la journée d'études du 13 décembre 2001, 2005. pp. 27-34 (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole)

BEAUME Georges. La nuit de Maguelone.- Paris : L. Borel, 1901.- 1 vol. (116 p.) (Archives départementales de l'Hérault, coté BRA 10373)

BOUCASSERT Manlius. Histoire du siège épiscopal de Maguelone et de Montpellier. - Montpellier : J. Martel aîné, 1876. -258 p. (Archives départementales de l'Hérault, coté CRC 241)

BOUDET Gérard. Le sel du Midi au XIXe siècle : La renaissance des salins du Midi de la France. Paris : Ed. Compagnie des Salins du Midi et des Salines de l'Est, 1995. - 269 p. (Archives départementales de l'Hérault, coté BIB 1882)

BOUDOU Nadine. L'exploitation salinière dans l'Hérault : l e salin de Villeneuve-lès-Maguelone. In : Études héraultaises 1994, n° 10 Nouvelle série. - pp. 89-96 (disponible sur le site des Études héraultaises : http://www.etudesheraultaises.fr/wp-content/uploads/1994-11-l-exploitation-saliniere-dans-l-herault-le-salin-de-villeneuve-les-maguelone.pdf)

BRESSOLETTE Henri. Le linteau de Maguelone. In : Église de Montpellier 1987 ; pp. 1095-1096 (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole)

BRUNIQUEL Paul. Le déclin de Maguelone et la Réforme en Languedoc. - Montepessulano : F. Poursines, 1970.- 101 p. (Archives départementales de l'Hérault, coté BRA 356)

BRUNIQUEL Paul. Les clés de Maguelone. - [Palavas-les-Flots] : P. Bruniquel, impr. en 1966.- 1 vol. (157 p.) (Archives départementales de l'Hérault, coté BRA 10526)

BURIOT-DARSILES H., BRUNHES Gabriel. Maguelone, petite île, grand passé : suivi d'un guide du touriste. - Montpellier : Dubois et Poulain, 1937.- 206 p. (Archives départementales de l'Hérault, coté CRC 244)

BURGOS André. Maguelone : histoire et architecture. In : Études héraultaises 2016, n° 46 ; pp. 5-13 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 3714)

CANET Marie-Claire. Analyse commentaire de deux textes tirés du cartulaire de Maguelone. - [S.l. : s.n., [1960]-[1970].- 23 f. (Archives départementales de l'Hérault, coté TAR 367)

CHAILLAN Marcellin. Documents sur Villeneuve, Poussan, Balaruc dotations du stadium de Gigean 1364-1369. In : Mémoires de la Société archéologique de Montpellier 1922 Deuxième série tome 8 pp. 307-343 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 1334)

COMTE Jean-Marie. Notes sur le cartulaire de Maguelone. - [S.l. : s.n.], 1964.- 24 f. (Archives départementales de l'Hérault, coté TAR 412)

DARTEIN Fernand (de). Études sur les ponts en pierre remarquables par leur décoration antérieurs au XIXe siècle. Paris : éd. Librairie polytechnique ch. Béranger, 1908. 211 p. (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole)

FABREGE Frédéric. Histoire de Maguelone : le site et les souvenirs : introduction de l'ouvrage. - Montpellier : J. Martel aîné, 1893.- 1 vol. (96 p.) (Archives départementales de l'Hérault, coté BRA 10571)

GERMAIN Alexandre Charles. Histoire de Villeneuve-lès-Maguelonne. Paris : éd. Res universis, 1990. - 64-16 p.-[1] f. de pl. (Monographies des villes et villages de France, 325) 1947 (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole, coté OC944.840VIL)

GERMAIN Alexandre Charles. Chronique inédite de Maguelone. In : Mémoires de la Société archéologique de Montpellier 1850-1854, tome 3. - pp. 357-370 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 1334)

GERMAIN Alexandre Charles. Villeneuve-lez-Maguelone ; ses origines, ses privilèges et ses libertés. In : Mémoires de la Société archéologique de Montpellier tome 3, 1850-1854. pp. 273-332 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 1334)

GERMAIN Alexandre. Maguelone sous ses évêques et ses chanoines. - Nîmes : C. Lacour, 2008 (30-Nîmes : Impr. C. Lacour-Ollé).- 1 vol. (318 p.) (Archives départementales de l'Hérault, coté BIB 3349)

GERMAIN Alexandre Charles. Étude historique sur les comtes de Maguelone, de Substantion et de Melgueil. In : Mémoires de la Société archéologique de Montpellier 1850-1854. - pp. 523-640 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 1334)

GUERRERO Alain. Si mon école m'était contée : Histoire de l'école de Villeneuve-lès-Maguelone. - Villeneuve-lès-Maguelone : éd. Quaserns del Manja-pofres, 2004. 136 p. (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole, coté OC944.840VIL)

HAYEZ Anne-Marie. Le diocèse de Maguelone au temps des papes d'Avignon (1309-1378). - In : L'évêché de Maguelone au Moyen Âge : actes de la journée d'études du 13 décembre 2001, 2005. pp. 63-90 (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole)

Jean de Montlaur II (1231-1247). In : Revue historique du diocèse de Montpellier 1913-1914 cinquième année ; pp. 326-335 ; pp. 275-382 ; pp. 423-430 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 1341)

LASNE François-Xavier. Les testaments multiples de l'étude de Villeneuve les Maguelone : 1840-1939. - [S.l. : s.n.], 1985.- 61 f. (Archives départementales de l'Hérault, coté TAR 208)

LECHON René. - Les salines, vivant héritage. In : Patrimoines en région : revue régionale d'éducation au territoire par les patrimoines 2015-2016, hiver, n° 27 ; pp. 6-19 430 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 4056)

LEENHARDT Albert. Les Salins du Languedoc. Bellegarde : éd. Sadag. - 89 p. (Archives départementales de l'Hérault, coté CRC 442)

LEGRAND-GARNOTEL Alexandrine. L' île de Maguelone du IIIe au XIIIe siècle. volume I, texte. - [S.l. : s.n.], 2004.- 1 vol. (192 p.) (Archives départementales de l'Hérault, coté TAR 790)

LEGRAND-GARNOTEL Alexandrine. L' île de Maguelone du IIIe au XIIIe siècle. volume II, annexes. - [S.l. : s.n.], 2004.- 1 vol. (Archives départementales de l'Hérault, coté TAR 791)

LEGRAND-GARNOTEL Alexandrine. Maguelone, archéologie d'une île de la lagune languedocienne. In : Archéologie des rivages méditerranéens, 50 ans de recherche, 2010. - pp. 95-98 (Archives départementales de l'Hérault, coté BIB 4526)

LEMAITRE Jean-Loup. Les Statuts de Jean de Vissec (1331). In : L'évêché de Maguelone au Moyen Age : actes de la journée d'études du 13 décembre 2001, 2005. pp. 91-116 (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole)

MAURIN Yvette. Le problème de la mortalité dans les communes des étangs à la fin du XVIIIe et au début du XIXe siècle. In : Études héraultaises 1984, XV n° 5-6 ; pp. 31-36 (disponible sur le site des Études héraultaises http://www.etudesheraultaises.fr/wp-content/uploads/1984-5-6-06-le-probleme-de-la-mortalite-dans-les-communes-des-etangs.pdf)

MONTJARDIN R., ALBAGNAC R. Le gisement Fontbouisse côtier de Domenove-Villeneuve-les-Maguelonne (Hérault). In : Archéologie en Languedoc 1980, vol. 3 ; pp. 43-54 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 3712)

PARRA Manuelle. Aménagement et paysages : diagnostic en zone littorale languedocienne : de Villeneuve-lès-Maguelone à Frontignan-La-Peyrade. In : Bulletin de la Société Languedocienne de Géographie 1993 janvier, tome 26, fascicule 1-2 ; pp. 269-287 (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole)

PINTON Pierre. Un baiser de Villeneuve-les-Maguelonne, de 1900 à 1980. - [s. n.]. [S. l.] 1980. - 104 p. 1947 (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole, coté M2195)

POULET François. 1178 A.D. : Maguelone se dévoile : guide romancé de l'ancienne cathédrale de Maguelone. - [Sl] : [sn], DL 2013.- 1 vol. (446 p.) (Archives départementales de l'Hérault, coté BIB 7417)

RICARD Adolphe. - Réconciliation de l'église de Maguelone. In : Mémoires de la Société archéologique de Montpellier, tome 6, 1876. - pp. 621-641 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 1334)

RICHARD RALITE Jean-Claude, AMBERT Paul, Chalon Michel. Maguelone, grand passé, petite île (1967-1973) (I, II, III). In : Archéologie en Languedoc 1999, n° 23 ; pp. 179-210 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 3712)

RICHARD RALITE Jean-Claude. Maguelone, grand passé, petite île (1967-1973) (IV). In : Études héraultaises 2015, n° 45 ; pp. 5-13 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 3714)

RICHARD RALITE Jean-Claude. Maguelone, grand passé, petite île : recherches archéologiques et historiques, 1967-1973. - [Saint-Guilhem-le-Désert] : Arts et traditions rurales, 2015 [96] p. (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole, coté OC944.840VIL)

ROUQUETTE Julien. Bernard le Pénitent. In : Annales du Midi 1913-1914 cinquième année ; pp. 337-343 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 1305)

ROUQUETTE Julien, VILLEMAGNE Augustin. Bullaire de l'église de Maguelone. Tome premier, 1030-1216. - Montpellier : L. Valat, 1911.- 1 vol. (xxxiv, 415 p.) (Archives départementales de l'Hérault, coté BIB 4273 ; disponible également sur Gallica http://gallica.bnf.fr/ark:/12148/bpt6k95550z)

ROUQUETTE Julien, VILLEMAGNE Augustin. Bullaire de l'église de Maguelone. Tome deuxième, 1216-1303. - Montpellier : L. Valat ; Paris : Picard fils et Cie, 1914.- 1 vol. (XI-648 p.) (Archives départementales de l'Hérault, coté BIB 4274 ; disponible également sur Gallica : http://gallica.bnf.fr/ark:/12148/bpt6k95555p)

ROUQUETTE Julien, VILLEMAGNE Augustin. Cartulaire de Maguelone. Tome premier, [819-1203]. - Montpellier : L. Vallat, 1912.- 522 p. (Archives départementales de l'Hérault, coté BIB 631)

ROUQUETTE Julien, VILLEMAGNE Augustin. Cartulaire de Maguelone. Tome deuxième, [1204-1262]. - Montpellier : L. Vallat, 1914.- 895 p. (Archives départementales de l'Hérault, coté BIB 633)

ROUQUETTE Julien. Cartulaire de Maguelone. Tome troisième, [1263-1305]. - Vic-la-Gardiole (Hérault) : J. Rouquette, 1921.- 1143 p. (Archives départementales de l'Hérault, coté BIB 635)

ROUQUETTE Julien. Cartulaire de Maguelone. Tome quatrième, (septembre 1306- avril 1328). - Montpellier : J. Rouquette, 1924.- 740 p. (Archives départementales de l'Hérault, coté BIB 636)

ROUQUETTE Julien. Cartulaire de Maguelone. Tome cinquième, (14 mars 1328-15 mars 1339). - Montpellier : J. Rouquette, [s.d.].- 2 vol. (720 p.) (Archives départementales de l'Hérault, coté BIB 640)

ROUQUETTE Julien. Maurus de Valleville. In : Revue historique du diocèse de Montpellier 1909 -1910 première année ; pp. 48-50 (Archives départementales de l'Hérault, coté PAR 1341)

ROUQUETTE Julien. Histoire du diocèse de Maguelone. - Montpellier : Chez l'auteur, [1925]-[1926].- 2 vol. (vol.1, p.657-1054) (vol.2, p.1-80) SF (1871-1927) (Archives départementales de l'Hérault, coté CRC 240-1-2 ET 2-1)

VAN WILLIGEN Samuel, ANNA André (d'), RENAULT Stéphane. Le Néolithique moyen du sud-est de la France - 50 ans de recherches. - In : Archéologie des rivages méditerranéens, 50 ans de recherche, 2010. - pp. 165-173 (Archives départementales de l'Hérault, coté BIB 4526)

VERGER Jacques. Les évêques de Maguelone et les universités de Montpellier (XII-XIVe siècles). In : L'évêché de Maguelone au Moyen Age : actes de la journée d'études du 13 décembre 2001, 2005. pp. 117-130 (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole)

VIDAL Henri. Jean 1er de Montlaur, évêque de Maguelone (1160-1190). In : L'évêché de Maguelone au Moyen Age : actes de la journée d'études du 13 décembre 2001, 2005. pp. 35-62 (Réseau des médiathèques Montpellier Méditerranée Métropole)

VINAS André. Le sentiment religieux populaire des Baux à Maguelone jusqu'au début du XXe siècle. In : Religions dans le Monde Méditerranéen. - pp. 173-181 430 (Archives départementales de l'Hérault, coté BIB 6042)