La ville de Sète, port important de Languedoc, prit en charge institutionellement ses pauvres malades et les épidémies liées au transit matin à partir du XVIIe siècle. En 1693 existait déjà un "hospital", petite maison d'une seule pièce affectée aux soins "des pauvres de la ville ou des étrangers lorsqu'ils tombent malade sur le lieu". Un "procureur des pauvres" en était chargé. En 1700 Sète fonda un bureau de charité destiné à pourvoir à la subsistance des pauvres. Il était administré par deux intendants, un greffier et un trésorier.

Il reçut ses statuts épiscopaux en 1713. Les 1er et 2 octobre 1713, Mgr de Pas-Feuquières, évêque d'Agde, seigneur et comte de l'île de Sète déclarait : " nous avons trouvé tant de zèle et de pieux empressements dans les habitants pour l'établissement d'un hôpital que pour seconder leurs charitables intentions nous nous sommes crus obligés à y donner notre principale attention ". Les statuts donnés à Agde le 5 novembre précisent la nouvelle composition du bureau : les curés des deux paroisses, les six conseillers urbains, un syndic, un trésorier, mais aussi l'officier de justice ordinaire de l'évêque, symbole de la présidence épiscopale, alors que le procureur des pauvres dépendait toujours du Conseil politique.

Ainsi fut établie, sur la base de l'ordonnance de 1713, l'unique " œuvre pie " de la ville au profit des malades. Ce n'est qu'en 1729 qu'apparut la Miséricorde, autre œuvre de charité, dont l'objet était "l'assistance des familles indigentes".

Les locaux de l'hôpital étaient situés place de l'Hospitalet, dans le quartier haut de la ville près l'église Saint-Louis ; l'ancienne unique pièce abritait toujours hommes et femmes qu'on ne sépara qu'en 1732.

En 1719 s'ajouta la maison mitoyenne du curé Ancely et celle d'Alleman achetée en 1720. Des travaux de réfection furent exécutés en 1732 et l'inauguration officielle de l'Hôpital Saint-Charles eut lieu en 1754. L'hôpital s'augmenta d'une chapelle en 1737.

Le 11 mai 1742, l'hôpital reçut des lettres patentes reprenant les termes de l'ordonnance de création. L'hôpital subsista au-delà de la Révolution dans les mêmes bâtiments jusqu'en 1847. Les locaux furent alors transférés un peu à l'extérieur de la ville. L'ancien bâtiment abrite aujourd'hui la médiathèque et les archives municipales.

Les archives antérieures à 1790 sont peu nombreuses : elles sont constituées principalement des délibérations, de la comptabilité et des mouvements de population de 1759 à la Révolution. Beaucoup moins importantes que pour les autres fonds hospitaliers, ces archives anciennes sont néamoins précieuses pour documenter les prémices de l'hôpital moderne.

Pour la période moderne, les délibérations ont été intégralement conservées de l'an IV à 1946 (11 HDT 1 L 1-32). Si la comptabilité semble lacunaire, les registres d'admission sont en revanche complets pendant cette période (11 HDT 1 Q 1-103).

ARCHIVES ANTERIEURES A 1790

Administration de l'établissement : 11 HDT E 1-2

Mouvement de la population. : 11 HDT F 1-5

RCHIVES POSTERIEURES A 1790

Personnel : 11 HDT 2 K 1

Administration : 11 HDT 1 L 1-2 L 5

Comptabilité : 1 M 1-3 M 1

Fondations, dons et legs : 11 HDT 1 N 1-2

Comptabilité : 11 HDT 1 P 1-2

Population : 11 HDT 1 Q 1-103

Série C : intendance de Languedoc

C 552 : état de situation de l'hôpital de Sète et des changments qu'il conviendrait de faire dans son administration (XVIIIe s.)

C 559 : mémoire relatif à la visite de l'Hôpital de Sète effectuée par Imbert, inspecteur des hôpitaux (1781)

C 562 : états envoyés à l'Intendant sur les hôpitaux de la Province (1782).

C 571 : minute de réponse de l'Intendant à une demande de l'hôpital de Sète, concernant l'influence des officiers municipaux de la ville sur la nomination des administrateurs (1786)

C 744 : correspondance avec l'Intendant relative aux journées des marins traités à Sète (1787)

C 786 : réformation de quelques articles du règlement du Bureau de santé de Sète (1769)

C 1846 : demande de création d'un greffier du Bureau de Santé au port de Sète (1753)

C 4680 : inventaire du mobilier de l'Hôpital (1786)

C 6667 : plainte contre la supérieur de l'hôpital de Sète pour refus de recevoir un soldat blessé (1781)

Série HDT : archives hospitalières

3 HDT 1 N 31 : Comptes de recettes et de dépenses faites pour l'Hôpital Saint-Charles de la Ville de " Cette " par Antoine Lardat, trésorier (1776-1787).